در روز چهارشنبه، مسعود پزشکیان، رئیس جمهور، با تسلیت دوباره و آرزوی صبر برای خانواده‌های جان‌باختگان سانحه بندر شهید رجایی، درخواست مغفرت برای درگذشتگان و ابراز همدردی با مجروحین این حادثه، از وزرای کشور و راه و شهرسازی، استاندار هرمزگان، نیروهای مسلح، نیروهای هلال احمر و همه کسانی که از اولین ساعات پس از حادثه در روند امداد‌رسانی حضور داشتند و حس همدلی و وفاق را به نمایش گذاشتند، قدردانی کرد.
وی با تأکید بر ضرورت رسیدگی فوری به آسیب‌دیدگان حادثه بندر شهید رجایی، از مسئولان خواست تا اولاً شناسایی بستر‌ها و زمینه‌های وقوع حادثه و رفع آنها را مقدم بر یافتن مقصر داشته باشند و ثانیاً به دنبال اصلاح ساختاری، برنامه‌ای و مدیریتی اداره بنادر و گمرکات کشور باشند.
در ادامه، رئیس جمهور از همه کشورهایی که با دولت و ملت ایران در این حادثه ابراز همدردی کردند، قدردانی کرد و از دولت روسیه بابت اعزام تجهیزات و نیروهای امدادی تشکر کرد.
پزشکیان سپس از مسئولان مربوطه خواستند که با هماهنگی شرکت‌های بیمه‌گذار، پیگیری احصای خسارت‌ها و پرداخت هرچه سریع‌تر آنها را به عهده بگیرند تا خسارت‌دیدگان و آسیب‌دیدگان بیش از این متضرر و از آسیب‌های وارده متاثر نشوند.
وی همچنین از وزارت صنعت، معدن و تجارت خواست که با شناسایی و جمع‌آوری دقیق اطلاعات خودروهایی که در محدوده بندر از این انفجار آسیب دیده‌اند، با همکاری همه دستگاه‌ها، پیگیری کمک به جبران خسارت آنها را داشته باشند.
در ادامه سخنانش، رئیس جمهور بیان کرد که شناسایی علت و بستر وقوع این سانحه مقدم بر شناسایی عامل و مقصر حادثه است و اگر به دنبال مقصر باشیم، انگیزه بیشتری برای پنهان‌کاری وجود خواهد داشت. بنابراین، در وهله اول باید به دنبال شناسایی اشکالات و بسترهای وقوع این حادثه باشیم تا با رفع آنها، جلوی تکرار دوباره چنین فجایعی گرفته شود.
در این راستا، همه ارگان‌های درگیر باید با ارائه اطلاعات دقیق، نهایت همکاری و همراهی را در مسیر شناسایی زمینه‌های وقوع و پیشگیری از تکرار این سانحه داشته باشند.
پزشکیان مسئله مهم دیگر را دپوی حجم انبوه کانتینر در بندر شهید رجایی عنوان کرد و آن را غیرقابل قبول توصیف کرد. ویแนะนำ که رئیس سازمان اداری و استخدامی به سرعت با انجام مطالعات تطبیقی و بررسی‌های مقایسه‌ای، از نحوه اداره بنادر و گمرکات در دیگر کشورها، برترین و موفق‌ترین تجربه‌ها را شناسایی و بر اساس اطلاعات به دست آمده، نسبت به اصلاح ساختارها، برنامه‌ریزی و شکل مدیریت بنادر و گمرکات کشور اقدام کند.
رئیس جمهور خاطرنشان کرد که امروز با تکیه بر تکنولوژی‌ها و تجهیزات نوین، روند واردات کالا از خریداری در مبدأ، بارگیری، حمل، تخلیه، ترخیص تا توزیع به طور کامل و دقیق قابل رصد و پیگیری است. بنابراین، باید با انجام مطالعات تطبیقی، روندهای واردات و صادرات در کشور هرچه سریع‌تر اصلاح شوند و به ویژه معطلی کالا در بنادر به صفر نزدیک شود.
در پایان سخنان خود، پزشکیان از همه مسئولان مربوطه خواست، نهایت تلاش و دقت خود را به کار گیرند، تا با جبران سریع‌تر خسارات، آسیب‌دیدگان از این حادثه بیش از این دچار مشکل و سختی نشوند.
در این جلسه، وزیر کشور گزارش مبسوطی از حادثه بندر شهید رجایی و آسیب‌شناسی صورت گرفته از مشکلات و نقائص ساختاری، برنامه‌ای و فرآیندی و مدیریتی اداره بنادر کشور ارائه کرد. همچنین تعدادی از آیین‌نامه‌های مربوط به برنامه هفتم پیشرفت به تصویب رسید.